高校、科研院所是支撑地方基础科研能力的重要主体。近年来，黔东南大力实施基础科研能力提升计划，“三个强化”增强州内高校、科研院所科技创新和服务产业能力，促进其面向经济社会需求加大科技供给。
    一是强化科技创新条件提升。推动凯里学院依托重点学科建成“贵州省苗医药全省重点实验室”“贵州省特色园艺作物分子育种全省重点实验室”以及“黔东南州玻璃重点实验室”，通过高能级创新平台建设，进一步凝聚培养优秀创新人才，聚焦我州民族医药、山地特色农业、硅精深加工强化关键技术攻关。推动州农科院建成“从江梯田湿地生态系统贵州省野外科学观测研究站”，为我州生态文明建设和可持续发展提供基础支撑和条件保障。
    二是强化基础研究竞争力提升。连续三年设立州科技计划项目专项，对重点产业科技创新项目进行支持，夯实研究基础，为国家级、省级项目申报储备项目，进一步提升项目争取中的竞争力。依托州级基础研究计划项目储备，2024年，以凯里学院为主的科研单位争取省级基础研究计划项目资金同比增长66.67%，争取国家自然科学基金项目资金同比增长203.17%。
    三是强化机构创新能力提升。支持州农科院聚焦小杂粮和香禾糯争取贵州省科研机构创新能力建设项目，支持州林科所聚焦林下生态养鸡争取贵州省科研机构创新能力建设项目，支持州民研院聚焦苗侗医药健康产品争取贵州省科研机构创新能力建设项目。截至目前，州内三家科研院所均已获得立项支持，项目资金超400万元，其中州农科院获得两轮支持。